Ondersteuning van wetenschappelijk onderzoek
UMC Utrecht
Het onderzoek van Alexander Leemans houdt in het kort het volgende in:
'Rhabdomyosarcomen en Ewing-sarcomen zijn zeldzame tumoren met een prevalentie van ongeveer 35 gevallen per jaar in de Nederlandse pediatrische en adolescente populatie. Momenteel zijn er geen biomarkers die in een vroeg stadium van de behandeling van deze tumoren onderscheid kunnen maken tussen slechte en goede uitkomsten. Hoewel microstructurele weefseleigenschappen afgeleid van diffusie-MRI (dMRI) waardevolle biomarkers zouden kunnen zijn voor een vroege beoordeling van de werkzaamheid van de behandeling, bemoeilijken verschillen in scannerhardware en acquisitieprotocollen tussen locaties het samenvoegen van dMRI data die nodig is voor klinische besluitvorming in internationale onderzoeken. In dit project zullen we kunstmatige intelligentie (AI)-methodologie ontwikkelen voor het harmoniseren van dMRI data en het segmenteren van tumoren in MRI data. Hiermee kunnen we die ongewenste multicentervariabiliteit verminderen zodat we de biologische signatuur van de weefselmicrostructuur beter kunnen behouden en uitkomsten beter kunnen voorspellen.'
MRI-scans van pediatrische patiënten met rhabdomyosarcoma werden verzameld uit meerdere centra in heel Europa. In de eerste maanden van dit project werden de beelden en bijbehorende metadata georganiseerd in een database. Gezien onze interesse in de harmonisatie van diffusie-MRI-gegevens, werd een voorlopige studie uitgevoerd om te bepalen of ADC waarden die automatisch zijn berekend door scanners van verschillende leveranciers vergelijkbaar zijn met ADC waarden die zijn berekend met een gestandaardiseerde interne methode. Waarden binnen de tumoren werden vergeleken en er werd geen significant verschil gevonden in de subset van geanalyseerde beelden. Terwijl het onderzoek om onze huidige dataset uit te breiden met reeds bestaande scans nog steeds gaande is, is er een MRI acquisitieprotocol ontwikkeld voor het verkrijgen van een multi-scanner MRI-database op vrijwilligers. Bovendien is er een framework geïmplementeerd voor handmatige segmentatie van tumoren en belangrijke gezonde structuren, om te worden gebruikt als referentie voor toekomstige stappen in de studie.